2024년

• 2024.09.01.
  • 제21대 지성훈 원장 취임
• 2024.03.01.
  • 조직개편
    (충청북도자연과학교육원 분원 충청북도교육청환경교육센터→충청북도교육청으로 업무이관)

2022년

• 2022.03.22.
  • 충청북도교육청 환경교육센터 개관
• 2022.01.01.
  • 직제개편
    (충청북도교육청환경교육센터 신설, 전시체험부(과학체험팀)→창의인재부로 통합)

2021년

• 2021.11.05.
  • 충북수학체험센터 개관
• 2021.03.01.
  • 조직개편
    (융합인재부: 수학체험팀 신설)

2020년

• 2020.09.01.
  • 조직개편
    (창의인재부: 기획팀→교육기획팀, 창의교육팀 신설)

2019년

• 2019.09.06.
  • 충북과학체험관 개관
    (과학전시관→충북과학체험관)
• 2019.03.01.
  • 조직개편
    (충청북도교육과학연구원→충청북도자연과학교육원으로 기관명 변경)

2011년 ~ 2017년

• 2017.09.01.
  • 업무이관
    (진로교육부 업무 충청북도진로교육원으로 이관)
• 2016.09.01.
  • 직제개편
    (기획연구부→연구기획부, 진로상담부→진로교육부)
• 2013.05.22.
  • 충북진로진학지원센터(연수관 3층) 구축
• 2012.09.01.
  • 업무이관
    (정보지원부 업무 충청북도교육정보원으로 이관)
  • 직제개편(진로영재교육부 → 진로상담부)

2002년 ~ 2010년

• 2002.08.05.
  • 담당업무조정
    (교수학습지원센터, 영재교육센터 업무추가)
  • 직제개편
    (진로지도부→진로영재교육부, 총무과→총무부)

1999년

• 1999.10.15.
  • 충청북도교육과학연구원 신축 개관
• 1999.01.01.
  • 충청북도교육연구원과 충청북도과학교육원의 통합으로 충청북도교육과학연구원 설치
    (충청북도조례 제2429호)

1969년 ~ 1974년

• 1974.04.23.
  • 충청북도학생과학관 설치(충청북도조례 제619호)
• 1969.01.01.
  • 충청북도교육연구원 설치(충청북도조례 제314호)